Однажды карты начали падать с неба и они были подняты детьми по всему миру. Карты изображали различные среды обитания странных монстров, и каждый монстр имел свои способности. Дети придумали совершенно новую игру, не зная что это не просто игрушки....

Дэн, Маручо и Шун попадают в войну между двумя планетами Ниатией и Гандэлией. Гандэлия использует Бакуганов и людей в войне за покорение Ниатии. Они объединяют свои усилия с тремя новыми бойцами: принцессой Ниатии Фабией, другом Дэна — Джейком и...